В июне 2008 года законодатель передал право возбуждать уголовные дела следователям, а право принимать решение по делам в отношении спeцсубъектов (депутатов Госдумы, сенаторов, судей) перешло от генпрокурора к его заместителю, возглавляющему Следственный комитет при прокуратуре. Подчиненные председателя СКП получили право возбуждать дела против следователей и прокуроров. "Такое решение является ошибочным", — говорится в пояснительной записке: наделение следователей СКП правом возбуждения дел в отношении этих лиц создает основу для внепроцессуального давления на них органов следствия.
Генпрокурор Юрий Чайка много раз заявлял о необходимости вернуть его ведомству право возбуждать уголовные дела. С СКП даже в рабочем порядке такую инициативу никто не обсуждал, говорит представитель комитета.
По словам источника, близкого к Генпрокуратуре, ожидаются новые инициативы, усиливающие вес Чайки: депутаты инициируют увеличение с 24 часов до 10 дней срока, в течение которого прокурор может закрыть возбужденное следователем дело, и введут обязательное к исполнению указание прокурора.
Борьба за полномочия между генпрокурором Юрием Чайкой и председателем следственного комитета Александром Бастрыкиным началась сразу после выделения следственного комитета в отдельную структуру внутри прокуратуры, пишет 22 января "Коммерсант". Ведомство Чайки отчаянно пыталось вернуть себе былое силовое влияние, а ведомство Бастрыкина не желало делиться полномочиями.
Уже в ноябре 2007 года Генпрокуратура разработала законопроект, по которому следствие по делам средней и легкой тяжести передавалось органам дознания, подконтрольным Генпрокуратуре. Он принят не был. Отношения между следственным комитетом и Генпрокуратурой обострились настолько, что 19 февраля 2008 года на коллегии Генпрокуратуры тогдашний премьер-министр Виктор Зубков вынужден был призвать прокуроров и следователей "сохранить баланс полномочий".
Как отмечает издание, появление законопроекта Верховного суда стало еще одним этапом поиска "баланса полномочий", в котором перевес будет уже на стороне Генпрокуратуры: дела по спецсубъектам обычно бывают самыми громкими и резонансными.