По сообщению жены бывшего влиятельного чиновника, Перфилов заявлял о намерении покончить жизнь самоубийством после возобновления следствия по делу о похищенном у государства 20-процентом пакете акций Архангельского целлюлозно-бумажного комбината (АЦБК). По версии следствия, в середине 90-х годов Перфилов передал принадлежавшие государству 20 процентов акций АЦБК в уставный капитал компании "Северная целлюлоза", подконтрольной его тогдашнему зятю Владимиру Крупчаку. Он со временем умело перепродал акции по дешевке в оффшор компании PULP MILL HOLDING, по сути оставшись главным контролером крупнейшего предприятия.
Российский фонд федерального имущества несколько лет добивался признания решения о передаче акций незаконным. Однако ставший фактическим владельцем АЦБК Крупчак сумел избежать уголовного преследования и в декабре 2003 года получил неприкосновенность как депутат Государственной думы России. Весной 2008 года Крупчак был объявлен в международный розыск как фигурант дела о незаконном присвоении акций АЦБК. В настоящий момент он находится в Украине и о возвращении в Россию ничего не говорит.
Перфилов до недавнего времени не выезжал из Архангельска. О возобновлении расследования было объявлено в октябре 2008 года. Вскоре после этого, 9 ноября экс-чиновник исчез, оставив "предсмертную записку". По некоторым данным, он мог броситься с моста в Северную Двину, однако тело его пока не найдено. В Архангельске есть и другая версия происшедшего: якобы Перфилов мог быть переправлен на Украину к своему бывшему зятю, а имитация самоубийства была нужна, чтобы увести следствие.
