Нацболы Роман Попков, Елена Боровская, Алексей Макаров, Назир Магомедов, Сергей Медведев, Владимир Титов и Дмитрий Елизаров 26 марта 2008 года за хулиганство с применением предметов, используемых в качестве оружия (ст.213 ч.2 УК РФ), были приговорены к реальному лишению свободы на сроки от полутора до двух с половиной лет.
13 апреля 2006 года лидер нацболов Эдуард Лимонов вместе с группой его однопартийцев (около 15 человек, половина — девушки) пришли в Таганский районный суд Москвы на слушания по жалобе на отказ в регистрации партии. Около здания суда на них напали молодые люди в количестве примерно 40 человек. По свидетельствам нацболов, при нападении применялись яйца, камни, палки и устройства "Удар". Так, один из нацболов, Владимир Титов, попал в больницу после того, как ему в лицо выстрелили из "Удара". Об этом впоследствии в суде говорили более десяти свидетелей. Было возбуждено уголовное дело, однако примерно через месяц нападавшие превратились в "потерпевших", а защищавшиеся нацболы — в подсудимых.
15 мая 2006 года сотрудники милиции ворвались в Московский ГК КПРФ, где проходило собрание Московского отделения НБП, взломали двери и увели с собой Романа Попкова, Назира Магомедова, Сергея Медведева и Владимира Титова. Проверка, проведенная Симоновской прокуратурой Москвы по жалобам коммунистов-депутатов Мосгордумы, никаких нарушений в действиях сотрудников милиции не выявила. Через два месяца были арестованы Елена Боровская и Алексей Макаров. Еще через год был арестован Дмитрий Елизаров. Дома у него остались больная жена и малолетняя дочка.
Европейский Суд, куда обратились обвиняемые и их защита, посчитал обстоятельства дела чрезвычайными и принял решение придать приоритет трем жалобам — Романа Попкова, Алексея Макарова и Дмитрия Елизарова; чуть позже — еще двум: Елены Боровской и Сергея Медведева. Роману Попкову и Алексею Макарову Европейский Суд присудил по 5000 евро, признав, что в отношении них были нарушены положения статьи 5 часть 3 Европейской Конвенции о защите прав человека и основанных свобод.